Микробиологиялық зерттеулер ағзадағы жұқпалы аурулардың қоздырғыштарының болуын жоғары дәлдік пен сенімділікпен растауға немесе жоққа шығаруға мүмкіндік береді. Бұл талдау оқшауланған микроорганизмдердің антибиотиктерге сезімталдық деңгейін анықтаудың тиімді әдісі болып табылады.
Сынақ үшін биологиялық материал биологиялық сұйықтықтар, нәжістің қатты фрагменттері, шырышты қабаттардан алынған жағындылар, эндоскопиялық немесе басқа инвазивті зерттеулер арқылы алынған тіндердің биопсиясы болуы мүмкін.